認定標準不同：
小規(guī)模納稅人：年應(yīng)征增值稅銷售額 500 萬元及以下。年應(yīng)稅銷售額是指納稅人在連續(xù)不超過 12 個月或四個季度的經(jīng)營期內(nèi)累計應(yīng)征增值稅銷售額，包括納稅申報銷售額、稽查查補銷售額、納稅評估調(diào)整銷售額。不過，銷售服務(wù)、無形資產(chǎn)或者不動產(chǎn)有扣除項目的納稅人，其應(yīng)稅行為年應(yīng)稅銷售額按未扣除之前的銷售額計算。納稅人偶然發(fā)生的銷售無形資產(chǎn)、轉(zhuǎn)讓不動產(chǎn)的銷售額，不計入應(yīng)稅行為年應(yīng)稅銷售額。
一般納稅人：增值稅納稅人年應(yīng)稅銷售額超過財政部、國家稅務(wù)總局規(guī)定的小規(guī)模納稅人標準的，應(yīng)當向主管稅務(wù)機關(guān)辦理一般納稅人登記。但按照政策規(guī)定，選擇按照小規(guī)模納稅人納稅的和年應(yīng)稅銷售額超過規(guī)定標準的其他個人除外。
稅率與征收率不同：
小規(guī)模納稅人：增值稅征收率為 3% 或 5%。自 2020 年 3 月 1 日至 2021 年 12 月 31 日，全國各省、自治區(qū)、直轄市的增值稅小規(guī)模納稅人，適用 3% 征收率的應(yīng)稅銷售收入，減按 1% 征收率征收增值稅。適用 5% 征收率的情況包括銷售不動產(chǎn)、出租不動產(chǎn)及土地、房地產(chǎn)開發(fā)企業(yè)銷售自行開發(fā)的房地產(chǎn)項目、勞務(wù)派遣服務(wù)及安全保護服務(wù)等。
一般納稅人：根據(jù)不同的行業(yè)和業(yè)務(wù)，稅率分為 13%、9%、6%、0% 四檔。納稅人銷售貨物、勞務(wù)、有形動產(chǎn)租賃服務(wù)或者進口貨物，除特殊規(guī)定外，稅率為 13%；銷售交通運輸、郵政、基礎(chǔ)電信、建筑、不動產(chǎn)租賃服務(wù)，銷售不動產(chǎn)，轉(zhuǎn)讓土地使用權(quán)，銷售或者進口特定貨物，稅率為 9%；銷售特定服務(wù)、無形資產(chǎn)，稅率為 6%；出口貨物，境內(nèi)單位和個人跨境銷售國務(wù)院規(guī)定范圍內(nèi)的服務(wù)、無形資產(chǎn)，稅率為 0%。此外，一般納稅人還可以選擇適用簡易計稅方法計稅，但一經(jīng)選擇，36 個月內(nèi)不得變更，按簡易征收適用 5%、3% 征收率。
計稅方法不同：
小規(guī)模納稅人：采用簡易計稅方法，應(yīng)納稅額 = 銷售額 × 征收率，不得抵扣進項稅額。
一般納稅人：采用一般計稅方法，應(yīng)納稅額 = 當期銷項稅額 - 當期進項稅額。
發(fā)票使用不同：
小規(guī)模納稅人：通常只能開具增值稅普通發(fā)票，需要專用發(fā)票時要向稅務(wù)機關(guān)申請代開。但部分行業(yè)的小規(guī)模納稅人可以自行開具增值稅專用發(fā)票。
一般納稅人：可以自行開具增值稅專用發(fā)票和普通發(fā)票。
進項稅額抵扣不同：
小規(guī)模納稅人：購進貨物或服務(wù)的進項稅額不能抵扣，應(yīng)將其計入成本。
一般納稅人：購進貨物或服務(wù)取得合法合規(guī)的增值稅專用發(fā)票等憑證，其進項稅額可以抵扣銷項稅額。
稅收優(yōu)惠政策不同：
小規(guī)模納稅人：享受更多的稅收優(yōu)惠，如自 2021 年 4 月 1 日至 2022 年 12 月 31 日，小規(guī)模納稅人發(fā)生增值稅應(yīng)稅銷售行為，合計月銷售額未超過 15 萬元（以 1 個季度為 1 個納稅期的，季度銷售額未超過 45 萬元）的，免征增值稅。此外，增值稅小規(guī)模納稅人已依法享受資源稅、城市維護建設(shè)稅、房產(chǎn)稅、城鎮(zhèn)土地使用稅、印花稅、耕地占用稅、教育費附加、地方教育附加其他優(yōu)惠政策的，可疊加享受上述規(guī)定的優(yōu)惠政策。
一般納稅人：稅收優(yōu)惠相對較少，但也可享受如減免資源稅、城市維護建設(shè)稅、教育附加費等政策，以及在稅收優(yōu)惠園區(qū)享受核定征收政策等。
財務(wù)核算要求不同：
小規(guī)模納稅人：財務(wù)核算要求相對較寬松。
一般納稅人：財務(wù)核算要求較為嚴格，需要準確核算銷項稅額、進項稅額和應(yīng)納稅額等，按照國家統(tǒng)一的會計制度規(guī)定設(shè)置賬簿，根據(jù)合法、有效憑證核算，能夠提供準確稅務(wù)資料。